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珠海红树林主要分布淇澳岛、横琴岛和红旗西堤、磨刀门和鸡啼门水道出海口附近堤岸，其中，位于淇澳岛西北部大围湾的湿地面积最大，是目前该市保存最完整、最集中连片的林分，树高4-6米。它不仅是珠海市的珍稀资源，也是珠江三角洲不可多得的一片红树林湿地，同时是全国少有的紧靠大城市的红树林区之一。
淇澳红树林保护区位于淇澳岛西北部，保护区拥有维管植物695种，野生动物347种，其中真红树植物有15种，半红树植物9种。生长在海滩上的红树林既是防风固沙、防波保堤的海上森林，也是鸟类和海洋生物栖息、繁衍的良好场所，更是中国三大候鸟迁徙路径之一，秋冬季栖息着数以万计，90多个种类迁飞的候鸟。
据新近的调查显示：淇澳岛红树林湿地保护区内共拥有底栖动物5纲14目48科103种；鱼类1纲10目41科90种；有陆生脊椎野生动物4纲25目，58科1 56种（含两栖动物15
种、爬行动物27种、鸟类99种、哺乳动物15种）。
同时，保护区境内有属国家重点保护动物，也是珍稀濒危动物共计15种，占广东省珍稀濒危动物总数（117种）的12.8%，其中国家Ⅰ级重点保护动物有1种（中华白海豚），Ⅱ级重点保护动物14种（如虎纹蛙、鸢、风头鹰、赤腹鹰、松雀鹰、水獭等），淇澳岛保护区是中国三大候鸟迁徙路径之一，秋冬季栖息着许多跨境的越冬候鸟和在此停留的候鸟，这些种类许多都是国际协定中的保护鸟类，如中日候鸟保护协定中的34种鸟类，占候鸟保护协定总数（227种）的15%；中澳候鸟保护协定中的16种鸟类，占中澳候鸟协定总数（81种）的19.8%，此外，区内还具有濒危野生动植物中国际公约确定的物种20种。另外，还有广东省省级重点保护动物的17种，国家“三有”保护动物113种。
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